2008年1月1日起，新的企業(yè)所得稅制度開始實(shí)行，新制度采用的是“法人所得稅制”。為了保證《企業(yè)所得稅法》的順利實(shí)施，妥善處理地區(qū)間利益分配關(guān)系，財政部、國家稅務(wù)總局隨后下發(fā)了《跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理暫行辦法》（國稅發(fā)[2008]28號），規(guī)范了總分機(jī)構(gòu)企業(yè)所得稅分配及預(yù)算管理的辦法。其中針對于跨地區(qū)（指跨省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市，下同）經(jīng)營建筑企業(yè)業(yè)所得稅征收管理問題，國家稅務(wù)總局先后下發(fā)了若干文件進(jìn)行明確規(guī)定。
    2010年4月19日，國家稅務(wù)總局下發(fā)了《關(guān)于跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)所得稅征收管理問題的通知》，即國稅函[2010]156號文，對跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)所得稅征收管理問題做了進(jìn)一步明確調(diào)整和補(bǔ)充。國稅函[2010]156號重點(diǎn)突出了以下內(nèi)容：
    一、重申法人稅制精神
    156號文重申國稅函[2010]39號中關(guān)于實(shí)行總、分機(jī)構(gòu)體制的跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)需要就地預(yù)繳企業(yè)所得稅的規(guī)定，實(shí)行總分機(jī)構(gòu)體制的跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)應(yīng)嚴(yán)格執(zhí)行國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定，按照“統(tǒng)一計算，分級管理，就地預(yù)繳，匯總清算，財政調(diào)庫”的辦法計算繳納企業(yè)所得稅。
    文件規(guī)定，建筑企業(yè)總機(jī)構(gòu)應(yīng)按照有關(guān)規(guī)定辦理企業(yè)所得稅年度匯算清繳，各分支機(jī)構(gòu)和項目部不進(jìn)行匯算清繳?？倷C(jī)構(gòu)年終匯算清繳后應(yīng)納所得稅額小于已預(yù)繳的稅款時，由總機(jī)構(gòu)主管稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理退稅或抵扣以后年度的應(yīng)繳企業(yè)所得稅。
    二、征管方式有所變化
    1、總機(jī)構(gòu)直接管理的跨地區(qū)項目部需就地預(yù)繳所得稅
    156號文針對總機(jī)構(gòu)的直接管理的跨地區(qū)設(shè)立的項目部納稅政策進(jìn)行了調(diào)整。國稅函[2010]39號曾規(guī)定，建筑企業(yè)跨地區(qū)設(shè)立的不符合二級分支機(jī)構(gòu)條件的項目經(jīng)理部（包括與項目經(jīng)理部性質(zhì)相同的工程指揮部、合同段等），應(yīng)匯總到總機(jī)構(gòu)或二級分支機(jī)構(gòu)統(tǒng)一計算，按照國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定的辦法計算繳納企業(yè)所得稅。
    156號文則規(guī)定，建筑企業(yè)所屬二級或二級以下分支機(jī)構(gòu)直接管理的項目部（包括與項目部性質(zhì)相同的工程指揮部、合同段等，下同）不就地預(yù)繳企業(yè)所得稅，其經(jīng)營收入、職工工資和資產(chǎn)總額應(yīng)匯總到二級分支機(jī)構(gòu)統(tǒng)一核算，由二級分支機(jī)構(gòu)按照國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定的辦法預(yù)繳企業(yè)所得稅。
    該項政策規(guī)定之變化在于，總機(jī)構(gòu)直接管理的不符合二級分支機(jī)構(gòu)條件的項目部未包括在不就地預(yù)繳企業(yè)所得稅的范圍之內(nèi)，即總機(jī)構(gòu)直接管理的不符合二級分支機(jī)構(gòu)條件的項目部需要就地預(yù)繳企業(yè)所得稅。