1、取消了代表機構(gòu)征免稅業(yè)務(wù)活動的劃分
國稅發(fā)［1996］165號文將代表機構(gòu)的業(yè)務(wù)活動分為征稅業(yè)務(wù)活動和不予征稅業(yè)務(wù)活動兩類，國稅發(fā)[2010]18號文將國稅發(fā)[1996]165號文 件廢止，不再區(qū)分應(yīng)稅業(yè)務(wù)活動和不予征稅業(yè)務(wù)活動，代表機構(gòu)取得的收入均應(yīng)按照企業(yè)所得稅法的有關(guān)規(guī)定計算繳納企業(yè)所得稅。
2、取消了外國政府、國際組織、非營利機構(gòu)、各民間團體等在我國設(shè)立的代表機構(gòu)免稅待遇
《國家稅務(wù)總局關(guān)于外國企業(yè)常駐代表機構(gòu)有關(guān)稅收管理問題的通知》（國稅發(fā)[2003]28號）規(guī)定，外國政府、國際組織、非營利機構(gòu)、各民間團體等在我 國設(shè)立的代表機構(gòu)，可由代表機構(gòu)(或其總機構(gòu)、上級部門等)向當?shù)刂鞴車叶悇?wù)局或地方稅務(wù)局提出免稅申請，經(jīng)當?shù)囟悇?wù)機關(guān)審核后，層報國家稅務(wù)總局批 準。國稅發(fā)[2010]18號文取消了該項稅收優(yōu)惠，外國政府等設(shè)立的代表機構(gòu)，取得的應(yīng)稅收入也需要按照規(guī)定申報繳納企業(yè)所得稅。
3、明確代表機構(gòu)發(fā)生增值稅、營業(yè)稅應(yīng)稅行為時應(yīng)按規(guī)定納稅
辦法規(guī)定，代表機構(gòu)發(fā)生增值稅、營業(yè)稅應(yīng)稅行為，應(yīng)按照增值稅和營業(yè)稅的相關(guān)法規(guī)計算繳納應(yīng)納稅款。
《營業(yè)稅暫行條例》修改后，最大的一個變化是境內(nèi)應(yīng)稅行為的含義發(fā)生變化，新的《營業(yè)稅暫行條例》規(guī)定，提供或者接受條例規(guī)定勞務(wù)的單位或者個人在境內(nèi)， 就為境內(nèi)勞務(wù)。因此代表機構(gòu)在境內(nèi)提供的營業(yè)稅應(yīng)稅勞務(wù)，以及在境外向境內(nèi)企業(yè)提供的營業(yè)稅勞務(wù)，均應(yīng)按照規(guī)定繳納營業(yè)稅。