二級(jí)分支機(jī)構(gòu)所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)自行對(duì)其主管二級(jí)分支機(jī)構(gòu)實(shí)施稅務(wù)檢查，可對(duì)查實(shí)項(xiàng)目按照《企業(yè)所得稅法》的規(guī)定自行計(jì)算查增的應(yīng)納稅所得額和應(yīng)納稅額。 　　

計(jì)算查增的應(yīng)納稅所得額時(shí)，應(yīng)減除允許彌補(bǔ)的匯總納稅企業(yè)以前年度虧損；對(duì)于需由總機(jī)構(gòu)統(tǒng)一計(jì)算的稅前扣除項(xiàng)目，不得由分支機(jī)構(gòu)自行計(jì)算調(diào)整。 　　

二級(jí)分支機(jī)構(gòu)應(yīng)將查補(bǔ)所得稅款的50%分?jǐn)偨o總機(jī)構(gòu)繳納，其中25%就地辦理繳庫(kù)，25%就地全額繳入中央國(guó)庫(kù)；50%分?jǐn)偨o該二級(jí)分支機(jī)構(gòu)就地辦理繳庫(kù)。具體的稅款繳庫(kù)程序按照財(cái)預(yù)[2012]40號(hào)文件第五條等相關(guān)規(guī)定執(zhí)行。 　　

匯總納稅企業(yè)繳納查補(bǔ)所得稅款時(shí)，總機(jī)構(gòu)應(yīng)向其所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)報(bào)送經(jīng)二級(jí)分支機(jī)構(gòu)所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)受理的匯總納稅企業(yè)分支機(jī)構(gòu)所得稅分配表和二級(jí)分支機(jī)構(gòu)所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)出具的稅務(wù)檢查結(jié)論，二級(jí)分支機(jī)構(gòu)也應(yīng)向其所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)報(bào)送匯總納稅企業(yè)分支機(jī)構(gòu)所得稅分配表和稅務(wù)檢查結(jié)論。 　　

第二十九條 稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)將匯總納稅企業(yè)總機(jī)構(gòu)、分支機(jī)構(gòu)的稅務(wù)登記信息、備案信息、總機(jī)構(gòu)出具的分支機(jī)構(gòu)有效證明情況及分支機(jī)構(gòu)審核鑒定情況、企業(yè)所得稅月（季）度預(yù)繳納稅申報(bào)表和年度納稅申報(bào)表、匯總納稅企業(yè)分支機(jī)構(gòu)所得稅分配表、財(cái)務(wù)報(bào)表（或年度財(cái)務(wù)狀況和營(yíng)業(yè)收支情況）、企業(yè)所得稅款入庫(kù)情況、資產(chǎn)損失情況、稅收優(yōu)惠情況、各分支機(jī)構(gòu)參與企業(yè)年度納稅調(diào)整情況的說(shuō)明、稅務(wù)檢查及查補(bǔ)稅款分?jǐn)偤腿霂?kù)情況等信息，定期分省匯總上傳至國(guó)家稅務(wù)總局跨地區(qū)經(jīng)營(yíng)匯總納稅企業(yè)管理信息交換平臺(tái)。 　　

第三十條 2008年底之前已成立的匯總納稅企業(yè)，2009年起新設(shè)立的分支機(jī)構(gòu)，其企業(yè)所得稅的征管部門(mén)應(yīng)與總機(jī)構(gòu)企業(yè)所得稅征管部門(mén)一致；2009年起新增匯總納稅企業(yè)，其分支機(jī)構(gòu)企業(yè)所得稅的管理部門(mén)也應(yīng)與總機(jī)構(gòu)企業(yè)所得稅管理部門(mén)一致。 　　

第三十一條 匯總納稅企業(yè)不得核定征收企業(yè)所得稅。 　　

第五章 附 則 　　

第三十二條 居民企業(yè)在中國(guó)境內(nèi)沒(méi)有跨地區(qū)設(shè)立不具有法人資格分支機(jī)構(gòu)，僅在同一省、自治區(qū)、直轄市和計(jì)劃單列市（以下稱(chēng)同一地區(qū)）內(nèi)設(shè)立不具有法人資格分支機(jī)構(gòu)的，其企業(yè)所得稅征收管理辦法，由各省、自治區(qū)、直轄市和計(jì)劃單列市國(guó)家稅務(wù)局、地方稅務(wù)局參照本辦法聯(lián)合制定。 　　

居民企業(yè)在中國(guó)境內(nèi)既跨地區(qū)設(shè)立不具有法人資格分支機(jī)構(gòu)，又在同一地區(qū)內(nèi)設(shè)立不具有法人資格分支機(jī)構(gòu)的，其企業(yè)所得稅征收管理實(shí)行本辦法。 　　

第三十三條 本辦法自2013年1月1日起施行。